Mateřské mléko přirozeně obsahuje prebiotické oligosacharidy (GOS), které stimulují střevní mikroflóru a podporují růst prospěšných bakterií ve střevě, díky čemuž napomáhají ke správné funkci imunitnímu systému. Některá kojenecká a batolecí mléka obsahují směs prebiotik GOS/FOS, která je inspirovaná výzkumy mateřského mléka.
Také LCP mastné kyseliny (kyseliny omega 3 a omega 6) mají důležitou roli při vývoji dítěte, jsou nepostradatelné pro vývoj mozku a přispívají ke správné funkci imunity. Dětský metabolismus si však na rozdíl od dospělých ještě nedokáže LCP mastné kyseliny v dostatečné míře sám vytvářet, a proto pokud nemůže být dítě kojeno, mělo by je dostávat ve stravě, nejlépe v umělé mléčné výživě.
